Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SH3BGRP55822 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms