Protein–RNA interactions for Protein: P55075

FGF8, Fibroblast growth factor 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGF8P55075 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FGF8P55075 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FGF8P55075 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FGF8P55075 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FGF8P55075 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FGF8P55075 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FGF8P55075 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FGF8P55075 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FGF8P55075 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FGF8P55075 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FGF8P55075 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FGF8P55075 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FGF8P55075 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FGF8P55075 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FGF8P55075 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FGF8P55075 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FGF8P55075 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FGF8P55075 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FGF8P55075 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FGF8P55075 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FGF8P55075 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FGF8P55075 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FGF8P55075 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FGF8P55075 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FGF8P55075 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FGF8P55075 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FGF8P55075 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FGF8P55075 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FGF8P55075 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FGF8P55075 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FGF8P55075 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FGF8P55075 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FGF8P55075 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FGF8P55075 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FGF8P55075 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FGF8P55075 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FGF8P55075 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FGF8P55075 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FGF8P55075 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FGF8P55075 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FGF8P55075 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FGF8P55075 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FGF8P55075 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FGF8P55075 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FGF8P55075 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FGF8P55075 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FGF8P55075 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FGF8P55075 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FGF8P55075 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FGF8P55075 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FGF8P55075 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FGF8P55075 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FGF8P55075 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FGF8P55075 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FGF8P55075 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FGF8P55075 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FGF8P55075 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FGF8P55075 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FGF8P55075 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FGF8P55075 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FGF8P55075 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FGF8P55075 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FGF8P55075 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FGF8P55075 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FGF8P55075 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FGF8P55075 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FGF8P55075 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FGF8P55075 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FGF8P55075 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FGF8P55075 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FGF8P55075 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FGF8P55075 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FGF8P55075 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FGF8P55075 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FGF8P55075 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FGF8P55075 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FGF8P55075 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FGF8P55075 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FGF8P55075 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FGF8P55075 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FGF8P55075 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FGF8P55075 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FGF8P55075 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FGF8P55075 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FGF8P55075 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FGF8P55075 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FGF8P55075 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FGF8P55075 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FGF8P55075 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FGF8P55075 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FGF8P55075 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FGF8P55075 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FGF8P55075 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FGF8P55075 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FGF8P55075 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FGF8P55075 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FGF8P55075 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FGF8P55075 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FGF8P55075 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FGF8P55075 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms