Protein–RNA interactions for Protein: P51965

UBE2E1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1P51965 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2E1P51965 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2E1P51965 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms