Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
SMARCA2P51531 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
SMARCA2P51531 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
SMARCA2P51531 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
SMARCA2P51531 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
SMARCA2P51531 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
SMARCA2P51531 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
SMARCA2P51531 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
SMARCA2P51531 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
SMARCA2P51531 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
SMARCA2P51531 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
SMARCA2P51531 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SMARCA2P51531 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SMARCA2P51531 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SMARCA2P51531 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SMARCA2P51531 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SMARCA2P51531 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SMARCA2P51531 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SMARCA2P51531 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SMARCA2P51531 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC34■■■■□ 3.03
SMARCA2P51531 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
SMARCA2P51531 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC34■■■■□ 3.03
SMARCA2P51531 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC34■■■■□ 3.03
SMARCA2P51531 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC34■■■■□ 3.03
SMARCA2P51531 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
SMARCA2P51531 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
SMARCA2P51531 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SMARCA2P51531 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SMARCA2P51531 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SMARCA2P51531 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SMARCA2P51531 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SMARCA2P51531 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
SMARCA2P51531 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SMARCA2P51531 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SMARCA2P51531 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SMARCA2P51531 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SMARCA2P51531 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SMARCA2P51531 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SMARCA2P51531 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SMARCA2P51531 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
SMARCA2P51531 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SMARCA2P51531 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
SMARCA2P51531 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SMARCA2P51531 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SMARCA2P51531 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SMARCA2P51531 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SMARCA2P51531 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SMARCA2P51531 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SMARCA2P51531 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SMARCA2P51531 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
SMARCA2P51531 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SMARCA2P51531 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SMARCA2P51531 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SMARCA2P51531 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SMARCA2P51531 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SMARCA2P51531 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SMARCA2P51531 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SMARCA2P51531 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SMARCA2P51531 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SMARCA2P51531 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SMARCA2P51531 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SMARCA2P51531 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SMARCA2P51531 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
SMARCA2P51531 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SMARCA2P51531 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SMARCA2P51531 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
SMARCA2P51531 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SMARCA2P51531 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
SMARCA2P51531 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SMARCA2P51531 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SMARCA2P51531 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SMARCA2P51531 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SMARCA2P51531 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SMARCA2P51531 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SMARCA2P51531 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SMARCA2P51531 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SMARCA2P51531 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SMARCA2P51531 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SMARCA2P51531 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SMARCA2P51531 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SMARCA2P51531 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SMARCA2P51531 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SMARCA2P51531 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
SMARCA2P51531 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SMARCA2P51531 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SMARCA2P51531 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SMARCA2P51531 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SMARCA2P51531 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SMARCA2P51531 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SMARCA2P51531 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SMARCA2P51531 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SMARCA2P51531 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SMARCA2P51531 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SMARCA2P51531 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SMARCA2P51531 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SMARCA2P51531 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SMARCA2P51531 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SMARCA2P51531 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SMARCA2P51531 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SMARCA2P51531 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms