Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPFP49454 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPFP49454 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPFP49454 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPFP49454 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPFP49454 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPFP49454 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPFP49454 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPFP49454 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPFP49454 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPFP49454 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPFP49454 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPFP49454 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPFP49454 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPFP49454 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPFP49454 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPFP49454 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPFP49454 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPFP49454 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPFP49454 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPFP49454 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPFP49454 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPFP49454 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPFP49454 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPFP49454 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CENPFP49454 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CENPFP49454 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CENPFP49454 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CENPFP49454 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CENPFP49454 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CENPFP49454 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CENPFP49454 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CENPFP49454 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CENPFP49454 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CENPFP49454 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPFP49454 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPFP49454 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPFP49454 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPFP49454 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPFP49454 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPFP49454 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPFP49454 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPFP49454 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPFP49454 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPFP49454 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPFP49454 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPFP49454 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPFP49454 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPFP49454 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPFP49454 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPFP49454 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPFP49454 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPFP49454 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPFP49454 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPFP49454 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPFP49454 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPFP49454 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPFP49454 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPFP49454 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPFP49454 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPFP49454 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPFP49454 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPFP49454 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPFP49454 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPFP49454 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPFP49454 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPFP49454 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
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CENPFP49454 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPFP49454 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPFP49454 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPFP49454 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPFP49454 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPFP49454 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPFP49454 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPFP49454 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPFP49454 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPFP49454 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPFP49454 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPFP49454 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
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CENPFP49454 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPFP49454 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPFP49454 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPFP49454 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPFP49454 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPFP49454 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPFP49454 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPFP49454 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPFP49454 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPFP49454 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPFP49454 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPFP49454 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPFP49454 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPFP49454 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPFP49454 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPFP49454 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPFP49454 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPFP49454 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
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