Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A3P48751 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A3P48751 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A3P48751 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A3P48751 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A3P48751 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A3P48751 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A3P48751 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A3P48751 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A3P48751 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A3P48751 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A3P48751 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A3P48751 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A3P48751 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A3P48751 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A3P48751 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC4A3P48751 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A3P48751 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A3P48751 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A3P48751 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A3P48751 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A3P48751 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A3P48751 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A3P48751 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A3P48751 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A3P48751 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A3P48751 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A3P48751 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A3P48751 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A3P48751 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A3P48751 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A3P48751 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A3P48751 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A3P48751 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A3P48751 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A3P48751 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A3P48751 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A3P48751 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A3P48751 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A3P48751 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A3P48751 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A3P48751 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A3P48751 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A3P48751 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A3P48751 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A3P48751 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A3P48751 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A3P48751 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A3P48751 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A3P48751 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A3P48751 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A3P48751 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A3P48751 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A3P48751 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A3P48751 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A3P48751 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A3P48751 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC4A3P48751 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC4A3P48751 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC4A3P48751 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC4A3P48751 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC4A3P48751 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC4A3P48751 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC4A3P48751 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC4A3P48751 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC4A3P48751 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC4A3P48751 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC4A3P48751 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC4A3P48751 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC4A3P48751 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC4A3P48751 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC4A3P48751 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC4A3P48751 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC4A3P48751 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC4A3P48751 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC4A3P48751 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A3P48751 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms