Protein–RNA interactions for Protein: P47914

RPL29, 60S ribosomal protein L29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL29P47914 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL29P47914 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL29P47914 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL29P47914 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL29P47914 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL29P47914 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL29P47914 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL29P47914 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL29P47914 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL29P47914 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL29P47914 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL29P47914 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL29P47914 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL29P47914 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL29P47914 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL29P47914 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL29P47914 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL29P47914 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL29P47914 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL29P47914 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL29P47914 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL29P47914 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL29P47914 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL29P47914 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL29P47914 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL29P47914 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL29P47914 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL29P47914 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL29P47914 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL29P47914 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL29P47914 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL29P47914 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL29P47914 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL29P47914 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL29P47914 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL29P47914 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL29P47914 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL29P47914 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL29P47914 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL29P47914 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL29P47914 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL29P47914 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL29P47914 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL29P47914 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL29P47914 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL29P47914 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL29P47914 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL29P47914 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL29P47914 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL29P47914 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL29P47914 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL29P47914 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL29P47914 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL29P47914 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL29P47914 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL29P47914 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL29P47914 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL29P47914 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL29P47914 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL29P47914 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL29P47914 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL29P47914 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL29P47914 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL29P47914 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL29P47914 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL29P47914 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL29P47914 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL29P47914 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL29P47914 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL29P47914 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL29P47914 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL29P47914 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL29P47914 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL29P47914 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL29P47914 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL29P47914 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL29P47914 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL29P47914 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL29P47914 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL29P47914 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL29P47914 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL29P47914 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL29P47914 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL29P47914 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL29P47914 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL29P47914 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL29P47914 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL29P47914 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL29P47914 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL29P47914 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL29P47914 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL29P47914 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL29P47914 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL29P47914 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL29P47914 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL29P47914 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL29P47914 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL29P47914 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL29P47914 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL29P47914 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms