Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP5P45974 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP5P45974 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP5P45974 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP5P45974 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
USP5P45974 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP5P45974 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP5P45974 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP5P45974 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP5P45974 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP5P45974 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP5P45974 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP5P45974 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
USP5P45974 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP5P45974 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP5P45974 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP5P45974 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP5P45974 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP5P45974 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP5P45974 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP5P45974 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP5P45974 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP5P45974 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP5P45974 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP5P45974 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP5P45974 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP5P45974 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP5P45974 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
USP5P45974 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP5P45974 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP5P45974 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP5P45974 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP5P45974 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP5P45974 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP5P45974 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP5P45974 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP5P45974 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP5P45974 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP5P45974 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP5P45974 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP5P45974 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP5P45974 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP5P45974 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP5P45974 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP5P45974 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP5P45974 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP5P45974 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP5P45974 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP5P45974 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP5P45974 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP5P45974 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP5P45974 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP5P45974 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP5P45974 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP5P45974 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP5P45974 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP5P45974 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP5P45974 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP5P45974 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
USP5P45974 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
USP5P45974 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP5P45974 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP5P45974 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP5P45974 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP5P45974 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP5P45974 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP5P45974 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP5P45974 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP5P45974 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP5P45974 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP5P45974 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP5P45974 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP5P45974 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
USP5P45974 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP5P45974 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP5P45974 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP5P45974 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP5P45974 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP5P45974 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP5P45974 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP5P45974 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP5P45974 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP5P45974 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP5P45974 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP5P45974 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP5P45974 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP5P45974 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP5P45974 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP5P45974 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP5P45974 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP5P45974 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP5P45974 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP5P45974 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP5P45974 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP5P45974 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP5P45974 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP5P45974 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP5P45974 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP5P45974 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP5P45974 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms