Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACADSBP45954 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms