Protein–RNA interactions for Protein: P41222

PTGDS, Prostaglandin-H2 D-isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDSP41222 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTGDSP41222 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms