Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
GRIK1P39086 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GRIK1P39086 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms