Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms