Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP6V1E1P36543 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP6V1E1P36543 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP6V1E1P36543 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP6V1E1P36543 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP6V1E1P36543 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ATP6V1E1P36543 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ATP6V1E1P36543 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ATP6V1E1P36543 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP6V1E1P36543 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms