Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNB1P35222 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms