Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA1P35221 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms