Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
OTX2P32243 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
OTX2P32243 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
OTX2P32243 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
OTX2P32243 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
OTX2P32243 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
OTX2P32243 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
OTX2P32243 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
OTX2P32243 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
OTX2P32243 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
OTX2P32243 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
OTX2P32243 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
OTX2P32243 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
OTX2P32243 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
OTX2P32243 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
OTX2P32243 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
OTX2P32243 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
OTX2P32243 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
OTX2P32243 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
OTX2P32243 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
OTX2P32243 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
OTX2P32243 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
OTX2P32243 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
OTX2P32243 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
OTX2P32243 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
OTX2P32243 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
OTX2P32243 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
OTX2P32243 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
OTX2P32243 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
OTX2P32243 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
OTX2P32243 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
OTX2P32243 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
OTX2P32243 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
OTX2P32243 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
OTX2P32243 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
OTX2P32243 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
OTX2P32243 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
OTX2P32243 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
OTX2P32243 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
OTX2P32243 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
OTX2P32243 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
OTX2P32243 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
OTX2P32243 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
OTX2P32243 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
OTX2P32243 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTX2P32243 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTX2P32243 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTX2P32243 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTX2P32243 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTX2P32243 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTX2P32243 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTX2P32243 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTX2P32243 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTX2P32243 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTX2P32243 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTX2P32243 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTX2P32243 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTX2P32243 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
OTX2P32243 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
OTX2P32243 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTX2P32243 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTX2P32243 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTX2P32243 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTX2P32243 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
OTX2P32243 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTX2P32243 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTX2P32243 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTX2P32243 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTX2P32243 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTX2P32243 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
OTX2P32243 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTX2P32243 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTX2P32243 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTX2P32243 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTX2P32243 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
OTX2P32243 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTX2P32243 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTX2P32243 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTX2P32243 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTX2P32243 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTX2P32243 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTX2P32243 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTX2P32243 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTX2P32243 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTX2P32243 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTX2P32243 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTX2P32243 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTX2P32243 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTX2P32243 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
OTX2P32243 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTX2P32243 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTX2P32243 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTX2P32243 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTX2P32243 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTX2P32243 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTX2P32243 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTX2P32243 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTX2P32243 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTX2P32243 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTX2P32243 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms