Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD34P28906 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD34P28906 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD34P28906 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD34P28906 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD34P28906 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD34P28906 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD34P28906 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD34P28906 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD34P28906 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD34P28906 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD34P28906 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CD34P28906 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD34P28906 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD34P28906 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD34P28906 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD34P28906 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD34P28906 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD34P28906 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD34P28906 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD34P28906 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD34P28906 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CD34P28906 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CD34P28906 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD34P28906 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD34P28906 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD34P28906 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CD34P28906 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD34P28906 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD34P28906 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD34P28906 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD34P28906 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD34P28906 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD34P28906 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD34P28906 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD34P28906 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD34P28906 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD34P28906 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD34P28906 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD34P28906 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD34P28906 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD34P28906 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD34P28906 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD34P28906 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD34P28906 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD34P28906 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD34P28906 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD34P28906 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD34P28906 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD34P28906 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD34P28906 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD34P28906 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD34P28906 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD34P28906 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CD34P28906 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD34P28906 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CD34P28906 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CD34P28906 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD34P28906 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD34P28906 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD34P28906 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD34P28906 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD34P28906 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD34P28906 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD34P28906 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD34P28906 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD34P28906 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD34P28906 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD34P28906 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD34P28906 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD34P28906 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CD34P28906 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD34P28906 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD34P28906 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD34P28906 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD34P28906 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD34P28906 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD34P28906 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD34P28906 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD34P28906 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD34P28906 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD34P28906 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD34P28906 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD34P28906 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD34P28906 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD34P28906 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD34P28906 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD34P28906 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD34P28906 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD34P28906 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CD34P28906 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CD34P28906 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD34P28906 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD34P28906 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD34P28906 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD34P28906 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD34P28906 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD34P28906 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD34P28906 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD34P28906 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms