Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SSFA2P28290 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SSFA2P28290 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms