Protein–RNA interactions for Protein: P27448

MARK3, MAP/microtubule affinity-regulating kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARK3P27448 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MARK3P27448 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MARK3P27448 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MARK3P27448 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MARK3P27448 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MARK3P27448 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MARK3P27448 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MARK3P27448 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MARK3P27448 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MARK3P27448 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MARK3P27448 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MARK3P27448 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MARK3P27448 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MARK3P27448 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MARK3P27448 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MARK3P27448 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MARK3P27448 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MARK3P27448 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MARK3P27448 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MARK3P27448 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MARK3P27448 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MARK3P27448 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MARK3P27448 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MARK3P27448 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MARK3P27448 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MARK3P27448 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MARK3P27448 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MARK3P27448 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MARK3P27448 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MARK3P27448 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MARK3P27448 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MARK3P27448 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MARK3P27448 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MARK3P27448 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MARK3P27448 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MARK3P27448 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MARK3P27448 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
MARK3P27448 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MARK3P27448 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MARK3P27448 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MARK3P27448 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MARK3P27448 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MARK3P27448 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MARK3P27448 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MARK3P27448 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MARK3P27448 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MARK3P27448 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MARK3P27448 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MARK3P27448 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MARK3P27448 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MARK3P27448 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MARK3P27448 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MARK3P27448 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MARK3P27448 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MARK3P27448 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MARK3P27448 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MARK3P27448 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MARK3P27448 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MARK3P27448 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MARK3P27448 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MARK3P27448 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MARK3P27448 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MARK3P27448 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MARK3P27448 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
MARK3P27448 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MARK3P27448 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MARK3P27448 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MARK3P27448 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MARK3P27448 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MARK3P27448 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MARK3P27448 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MARK3P27448 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MARK3P27448 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MARK3P27448 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MARK3P27448 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MARK3P27448 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MARK3P27448 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MARK3P27448 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MARK3P27448 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MARK3P27448 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MARK3P27448 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MARK3P27448 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MARK3P27448 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MARK3P27448 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MARK3P27448 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MARK3P27448 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MARK3P27448 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MARK3P27448 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
MARK3P27448 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
MARK3P27448 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MARK3P27448 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MARK3P27448 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MARK3P27448 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MARK3P27448 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MARK3P27448 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MARK3P27448 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MARK3P27448 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MARK3P27448 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MARK3P27448 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MARK3P27448 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms