Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
TNFSF4P23510 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms