Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD247P20963 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD247P20963 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD247P20963 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD247P20963 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD247P20963 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CD247P20963 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD247P20963 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD247P20963 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD247P20963 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD247P20963 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD247P20963 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD247P20963 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD247P20963 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD247P20963 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CD247P20963 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD247P20963 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CD247P20963 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD247P20963 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD247P20963 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD247P20963 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD247P20963 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD247P20963 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD247P20963 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD247P20963 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD247P20963 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CD247P20963 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD247P20963 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD247P20963 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD247P20963 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD247P20963 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD247P20963 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD247P20963 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD247P20963 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD247P20963 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD247P20963 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD247P20963 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD247P20963 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD247P20963 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD247P20963 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD247P20963 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD247P20963 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD247P20963 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD247P20963 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD247P20963 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD247P20963 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD247P20963 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD247P20963 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD247P20963 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD247P20963 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD247P20963 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD247P20963 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CD247P20963 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD247P20963 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD247P20963 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD247P20963 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD247P20963 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD247P20963 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD247P20963 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD247P20963 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD247P20963 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD247P20963 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD247P20963 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD247P20963 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD247P20963 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD247P20963 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD247P20963 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD247P20963 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD247P20963 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CD247P20963 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD247P20963 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD247P20963 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD247P20963 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD247P20963 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD247P20963 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD247P20963 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD247P20963 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD247P20963 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD247P20963 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD247P20963 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD247P20963 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD247P20963 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD247P20963 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD247P20963 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD247P20963 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD247P20963 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD247P20963 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD247P20963 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD247P20963 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CD247P20963 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CD247P20963 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CD247P20963 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CD247P20963 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CD247P20963 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD247P20963 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD247P20963 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD247P20963 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD247P20963 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD247P20963 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD247P20963 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms