Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATF3P18847 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
ATF3P18847 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATF3P18847 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATF3P18847 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATF3P18847 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
ATF3P18847 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATF3P18847 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATF3P18847 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATF3P18847 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATF3P18847 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ATF3P18847 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ATF3P18847 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ATF3P18847 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ATF3P18847 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATF3P18847 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATF3P18847 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATF3P18847 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATF3P18847 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATF3P18847 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ATF3P18847 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATF3P18847 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATF3P18847 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATF3P18847 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATF3P18847 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATF3P18847 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATF3P18847 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATF3P18847 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATF3P18847 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATF3P18847 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATF3P18847 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATF3P18847 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
ATF3P18847 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATF3P18847 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATF3P18847 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
ATF3P18847 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
ATF3P18847 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATF3P18847 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATF3P18847 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATF3P18847 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATF3P18847 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATF3P18847 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATF3P18847 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATF3P18847 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATF3P18847 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATF3P18847 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATF3P18847 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ATF3P18847 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ATF3P18847 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATF3P18847 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATF3P18847 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATF3P18847 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATF3P18847 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATF3P18847 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATF3P18847 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATF3P18847 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATF3P18847 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATF3P18847 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATF3P18847 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATF3P18847 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATF3P18847 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATF3P18847 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATF3P18847 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATF3P18847 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATF3P18847 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATF3P18847 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATF3P18847 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATF3P18847 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATF3P18847 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATF3P18847 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATF3P18847 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATF3P18847 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATF3P18847 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATF3P18847 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATF3P18847 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATF3P18847 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATF3P18847 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATF3P18847 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATF3P18847 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATF3P18847 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATF3P18847 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATF3P18847 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATF3P18847 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATF3P18847 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATF3P18847 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATF3P18847 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATF3P18847 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ATF3P18847 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATF3P18847 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATF3P18847 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ATF3P18847 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATF3P18847 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ATF3P18847 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATF3P18847 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATF3P18847 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATF3P18847 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATF3P18847 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATF3P18847 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATF3P18847 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATF3P18847 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms