Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms