Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RGPD1P0DJD0 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RGPD1P0DJD0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms