Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C4BP0C0L5 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C4BP0C0L5 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C4BP0C0L5 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C4BP0C0L5 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C4BP0C0L5 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
C4BP0C0L5 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C4BP0C0L5 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C4BP0C0L5 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C4BP0C0L5 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
C4BP0C0L5 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
C4BP0C0L5 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
C4BP0C0L5 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C4BP0C0L5 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C4BP0C0L5 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C4BP0C0L5 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C4BP0C0L5 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C4BP0C0L5 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C4BP0C0L5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C4BP0C0L5 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C4BP0C0L5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C4BP0C0L5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C4BP0C0L5 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C4BP0C0L5 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C4BP0C0L5 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C4BP0C0L5 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C4BP0C0L5 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C4BP0C0L5 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
C4BP0C0L5 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C4BP0C0L5 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C4BP0C0L5 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C4BP0C0L5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C4BP0C0L5 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
C4BP0C0L5 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C4BP0C0L5 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C4BP0C0L5 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C4BP0C0L5 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C4BP0C0L5 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C4BP0C0L5 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C4BP0C0L5 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C4BP0C0L5 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C4BP0C0L5 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C4BP0C0L5 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
C4BP0C0L5 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C4BP0C0L5 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C4BP0C0L5 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C4BP0C0L5 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C4BP0C0L5 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
C4BP0C0L5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C4BP0C0L5 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C4BP0C0L5 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C4BP0C0L5 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C4BP0C0L5 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C4BP0C0L5 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
C4BP0C0L5 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C4BP0C0L5 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C4BP0C0L5 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
C4BP0C0L5 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C4BP0C0L5 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C4BP0C0L5 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C4BP0C0L5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C4BP0C0L5 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C4BP0C0L5 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C4BP0C0L5 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C4BP0C0L5 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C4BP0C0L5 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C4BP0C0L5 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C4BP0C0L5 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C4BP0C0L5 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms