Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXB7P09629 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.8 ms