Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PKHD1P08F94 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms