Protein–RNA interactions for Protein: P08118

MSMB, Beta-microseminoprotein, humanhuman

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMBP08118 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSMBP08118 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSMBP08118 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSMBP08118 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSMBP08118 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSMBP08118 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSMBP08118 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSMBP08118 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSMBP08118 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSMBP08118 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSMBP08118 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSMBP08118 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSMBP08118 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSMBP08118 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSMBP08118 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSMBP08118 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MSMBP08118 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MSMBP08118 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MSMBP08118 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MSMBP08118 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MSMBP08118 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MSMBP08118 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MSMBP08118 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MSMBP08118 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MSMBP08118 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MSMBP08118 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MSMBP08118 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MSMBP08118 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MSMBP08118 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MSMBP08118 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MSMBP08118 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MSMBP08118 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MSMBP08118 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MSMBP08118 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MSMBP08118 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MSMBP08118 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MSMBP08118 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MSMBP08118 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MSMBP08118 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MSMBP08118 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MSMBP08118 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MSMBP08118 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MSMBP08118 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MSMBP08118 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MSMBP08118 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MSMBP08118 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MSMBP08118 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MSMBP08118 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MSMBP08118 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MSMBP08118 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MSMBP08118 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MSMBP08118 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MSMBP08118 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MSMBP08118 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MSMBP08118 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MSMBP08118 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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MSMBP08118 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MSMBP08118 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MSMBP08118 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
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MSMBP08118 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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MSMBP08118 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MSMBP08118 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MSMBP08118 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MSMBP08118 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MSMBP08118 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MSMBP08118 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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MSMBP08118 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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MSMBP08118 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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MSMBP08118 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MSMBP08118 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MSMBP08118 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MSMBP08118 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MSMBP08118 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MSMBP08118 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MSMBP08118 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MSMBP08118 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MSMBP08118 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MSMBP08118 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MSMBP08118 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MSMBP08118 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MSMBP08118 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MSMBP08118 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MSMBP08118 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MSMBP08118 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MSMBP08118 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MSMBP08118 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MSMBP08118 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MSMBP08118 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MSMBP08118 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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