Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLK3P07288 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLK3P07288 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLK3P07288 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLK3P07288 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLK3P07288 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLK3P07288 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLK3P07288 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLK3P07288 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLK3P07288 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLK3P07288 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
KLK3P07288 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLK3P07288 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLK3P07288 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLK3P07288 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLK3P07288 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLK3P07288 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLK3P07288 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLK3P07288 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLK3P07288 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
KLK3P07288 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLK3P07288 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLK3P07288 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLK3P07288 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLK3P07288 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLK3P07288 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLK3P07288 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLK3P07288 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLK3P07288 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLK3P07288 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLK3P07288 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLK3P07288 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLK3P07288 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLK3P07288 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLK3P07288 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLK3P07288 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLK3P07288 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLK3P07288 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLK3P07288 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLK3P07288 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLK3P07288 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLK3P07288 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLK3P07288 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLK3P07288 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLK3P07288 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLK3P07288 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLK3P07288 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLK3P07288 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLK3P07288 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLK3P07288 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KLK3P07288 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLK3P07288 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLK3P07288 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KLK3P07288 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLK3P07288 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLK3P07288 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLK3P07288 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLK3P07288 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLK3P07288 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLK3P07288 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLK3P07288 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLK3P07288 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLK3P07288 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KLK3P07288 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KLK3P07288 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLK3P07288 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLK3P07288 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLK3P07288 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLK3P07288 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLK3P07288 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLK3P07288 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLK3P07288 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLK3P07288 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLK3P07288 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLK3P07288 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLK3P07288 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLK3P07288 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLK3P07288 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KLK3P07288 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLK3P07288 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLK3P07288 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLK3P07288 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLK3P07288 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLK3P07288 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLK3P07288 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLK3P07288 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLK3P07288 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLK3P07288 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KLK3P07288 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLK3P07288 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLK3P07288 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLK3P07288 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLK3P07288 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLK3P07288 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLK3P07288 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLK3P07288 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLK3P07288 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLK3P07288 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLK3P07288 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLK3P07288 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms