Protein–RNA interactions for Protein: P05423

POLR3D, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3DP05423 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR3DP05423 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms