Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOA1P02647 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOA1P02647 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOA1P02647 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOA1P02647 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOA1P02647 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOA1P02647 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOA1P02647 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOA1P02647 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOA1P02647 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOA1P02647 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOA1P02647 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOA1P02647 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOA1P02647 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOA1P02647 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOA1P02647 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOA1P02647 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOA1P02647 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOA1P02647 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOA1P02647 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOA1P02647 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOA1P02647 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
APOA1P02647 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOA1P02647 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOA1P02647 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOA1P02647 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOA1P02647 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOA1P02647 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOA1P02647 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOA1P02647 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOA1P02647 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
APOA1P02647 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOA1P02647 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
APOA1P02647 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOA1P02647 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOA1P02647 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOA1P02647 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOA1P02647 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOA1P02647 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOA1P02647 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
APOA1P02647 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
APOA1P02647 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
APOA1P02647 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
APOA1P02647 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
APOA1P02647 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOA1P02647 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
APOA1P02647 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOA1P02647 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOA1P02647 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOA1P02647 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOA1P02647 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOA1P02647 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOA1P02647 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOA1P02647 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOA1P02647 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOA1P02647 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
APOA1P02647 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOA1P02647 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOA1P02647 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOA1P02647 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOA1P02647 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOA1P02647 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
APOA1P02647 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
APOA1P02647 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOA1P02647 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
APOA1P02647 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOA1P02647 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOA1P02647 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOA1P02647 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOA1P02647 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOA1P02647 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
APOA1P02647 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOA1P02647 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOA1P02647 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOA1P02647 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOA1P02647 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOA1P02647 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOA1P02647 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOA1P02647 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
APOA1P02647 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
APOA1P02647 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17■□□□□ 0.31
APOA1P02647 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17■□□□□ 0.31
APOA1P02647 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
APOA1P02647 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17■□□□□ 0.31
APOA1P02647 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
APOA1P02647 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOA1P02647 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOA1P02647 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOA1P02647 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOA1P02647 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
APOA1P02647 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOA1P02647 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOA1P02647 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
APOA1P02647 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOA1P02647 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOA1P02647 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOA1P02647 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOA1P02647 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOA1P02647 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOA1P02647 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms