Protein–RNA interactions for Protein: O94985

CLSTN1, Calsyntenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1O94985 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLSTN1O94985 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms