Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNKO75909 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNKO75909 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNKO75909 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNKO75909 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNKO75909 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCNKO75909 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCNKO75909 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCNKO75909 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCNKO75909 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCNKO75909 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCNKO75909 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCNKO75909 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCNKO75909 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCNKO75909 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
CCNKO75909 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNKO75909 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNKO75909 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNKO75909 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNKO75909 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNKO75909 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNKO75909 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNKO75909 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNKO75909 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNKO75909 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNKO75909 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNKO75909 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNKO75909 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNKO75909 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNKO75909 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNKO75909 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNKO75909 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNKO75909 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNKO75909 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNKO75909 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNKO75909 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNKO75909 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNKO75909 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNKO75909 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNKO75909 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCNKO75909 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCNKO75909 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCNKO75909 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCNKO75909 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCNKO75909 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCNKO75909 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCNKO75909 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCNKO75909 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCNKO75909 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCNKO75909 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCNKO75909 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCNKO75909 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCNKO75909 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCNKO75909 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCNKO75909 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCNKO75909 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCNKO75909 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCNKO75909 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCNKO75909 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCNKO75909 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCNKO75909 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCNKO75909 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCNKO75909 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCNKO75909 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCNKO75909 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCNKO75909 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCNKO75909 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCNKO75909 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCNKO75909 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCNKO75909 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCNKO75909 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCNKO75909 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCNKO75909 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCNKO75909 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCNKO75909 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCNKO75909 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCNKO75909 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCNKO75909 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCNKO75909 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCNKO75909 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCNKO75909 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCNKO75909 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCNKO75909 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCNKO75909 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCNKO75909 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCNKO75909 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCNKO75909 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCNKO75909 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCNKO75909 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCNKO75909 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCNKO75909 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCNKO75909 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCNKO75909 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCNKO75909 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCNKO75909 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCNKO75909 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCNKO75909 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCNKO75909 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCNKO75909 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCNKO75909 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms