Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
ABCC9O60706 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
ABCC9O60706 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC38.03■■■■□ 3.68
ABCC9O60706 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
ABCC9O60706 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
ABCC9O60706 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
ABCC9O60706 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
ABCC9O60706 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
ABCC9O60706 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
ABCC9O60706 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC38.02■■■■□ 3.68
ABCC9O60706 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC38.02■■■■□ 3.68
ABCC9O60706 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
ABCC9O60706 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC38.02■■■■□ 3.68
ABCC9O60706 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
ABCC9O60706 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
ABCC9O60706 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
ABCC9O60706 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC38.02■■■■□ 3.68
ABCC9O60706 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
ABCC9O60706 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
ABCC9O60706 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
ABCC9O60706 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
ABCC9O60706 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.68
ABCC9O60706 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.68
ABCC9O60706 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.68
ABCC9O60706 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC38.01■■■■□ 3.68
ABCC9O60706 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
ABCC9O60706 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
ABCC9O60706 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC38.01■■■■□ 3.67
ABCC9O60706 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.67
ABCC9O60706 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC38.01■■■■□ 3.67
ABCC9O60706 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC38.01■■■■□ 3.67
ABCC9O60706 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.67
ABCC9O60706 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC38.01■■■■□ 3.67
ABCC9O60706 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
ABCC9O60706 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC38■■■■□ 3.67
ABCC9O60706 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
ABCC9O60706 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
ABCC9O60706 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
ABCC9O60706 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC38■■■■□ 3.67
ABCC9O60706 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
ABCC9O60706 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
ABCC9O60706 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC38■■■■□ 3.67
ABCC9O60706 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
ABCC9O60706 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
ABCC9O60706 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
ABCC9O60706 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
ABCC9O60706 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
ABCC9O60706 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
ABCC9O60706 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
ABCC9O60706 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
ABCC9O60706 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
ABCC9O60706 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
ABCC9O60706 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.99■■■■□ 3.67
ABCC9O60706 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC37.99■■■■□ 3.67
ABCC9O60706 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC37.99■■■■□ 3.67
ABCC9O60706 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
ABCC9O60706 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
ABCC9O60706 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
ABCC9O60706 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
ABCC9O60706 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
ABCC9O60706 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
ABCC9O60706 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
ABCC9O60706 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
ABCC9O60706 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
ABCC9O60706 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
ABCC9O60706 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
ABCC9O60706 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
ABCC9O60706 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
ABCC9O60706 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
ABCC9O60706 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
ABCC9O60706 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
ABCC9O60706 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
ABCC9O60706 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
ABCC9O60706 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
ABCC9O60706 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
ABCC9O60706 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
ABCC9O60706 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.97■■■■□ 3.67
ABCC9O60706 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
ABCC9O60706 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
ABCC9O60706 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
ABCC9O60706 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
ABCC9O60706 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
ABCC9O60706 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
ABCC9O60706 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.97■■■■□ 3.67
ABCC9O60706 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
ABCC9O60706 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
ABCC9O60706 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
ABCC9O60706 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
ABCC9O60706 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
ABCC9O60706 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
ABCC9O60706 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
ABCC9O60706 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
ABCC9O60706 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
ABCC9O60706 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
ABCC9O60706 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC37.96■■■■□ 3.67
ABCC9O60706 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.96■■■■□ 3.67
ABCC9O60706 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
ABCC9O60706 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
ABCC9O60706 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
ABCC9O60706 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms