Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
KIAA0556O60303 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
KIAA0556O60303 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
KIAA0556O60303 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
KIAA0556O60303 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
KIAA0556O60303 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
KIAA0556O60303 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
KIAA0556O60303 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC30.18■■■□□ 2.42
KIAA0556O60303 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
KIAA0556O60303 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
KIAA0556O60303 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
KIAA0556O60303 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
KIAA0556O60303 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
KIAA0556O60303 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
KIAA0556O60303 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
KIAA0556O60303 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
KIAA0556O60303 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
KIAA0556O60303 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
KIAA0556O60303 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
KIAA0556O60303 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
KIAA0556O60303 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
KIAA0556O60303 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
KIAA0556O60303 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
KIAA0556O60303 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
KIAA0556O60303 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
KIAA0556O60303 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
KIAA0556O60303 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
KIAA0556O60303 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
KIAA0556O60303 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
KIAA0556O60303 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
KIAA0556O60303 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
KIAA0556O60303 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
KIAA0556O60303 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
KIAA0556O60303 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
KIAA0556O60303 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
KIAA0556O60303 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
KIAA0556O60303 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
KIAA0556O60303 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
KIAA0556O60303 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
KIAA0556O60303 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
KIAA0556O60303 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
KIAA0556O60303 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC30.17■■■□□ 2.42
KIAA0556O60303 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC30.17■■■□□ 2.42
KIAA0556O60303 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
KIAA0556O60303 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
KIAA0556O60303 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
KIAA0556O60303 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
KIAA0556O60303 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
KIAA0556O60303 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
KIAA0556O60303 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
KIAA0556O60303 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
KIAA0556O60303 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
KIAA0556O60303 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
KIAA0556O60303 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
KIAA0556O60303 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
KIAA0556O60303 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
KIAA0556O60303 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
KIAA0556O60303 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
KIAA0556O60303 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
KIAA0556O60303 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
KIAA0556O60303 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
KIAA0556O60303 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
KIAA0556O60303 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
KIAA0556O60303 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
KIAA0556O60303 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
KIAA0556O60303 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
KIAA0556O60303 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
KIAA0556O60303 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
KIAA0556O60303 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
KIAA0556O60303 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
KIAA0556O60303 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
KIAA0556O60303 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
KIAA0556O60303 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
KIAA0556O60303 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
KIAA0556O60303 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
KIAA0556O60303 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
KIAA0556O60303 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
KIAA0556O60303 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
KIAA0556O60303 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
KIAA0556O60303 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
KIAA0556O60303 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
KIAA0556O60303 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
KIAA0556O60303 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
KIAA0556O60303 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
KIAA0556O60303 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
KIAA0556O60303 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
KIAA0556O60303 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
KIAA0556O60303 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
KIAA0556O60303 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
KIAA0556O60303 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
KIAA0556O60303 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
KIAA0556O60303 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
KIAA0556O60303 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
KIAA0556O60303 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
KIAA0556O60303 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
KIAA0556O60303 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
KIAA0556O60303 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
KIAA0556O60303 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
KIAA0556O60303 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
KIAA0556O60303 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms