Protein–RNA interactions for Protein: O43916

CHST1, Carbohydrate sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST1O43916 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHST1O43916 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHST1O43916 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHST1O43916 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHST1O43916 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHST1O43916 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHST1O43916 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHST1O43916 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHST1O43916 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHST1O43916 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHST1O43916 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHST1O43916 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHST1O43916 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHST1O43916 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHST1O43916 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHST1O43916 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHST1O43916 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHST1O43916 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHST1O43916 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHST1O43916 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHST1O43916 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHST1O43916 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHST1O43916 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHST1O43916 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHST1O43916 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHST1O43916 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CHST1O43916 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHST1O43916 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHST1O43916 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHST1O43916 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHST1O43916 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHST1O43916 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CHST1O43916 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHST1O43916 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHST1O43916 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHST1O43916 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHST1O43916 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CHST1O43916 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CHST1O43916 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CHST1O43916 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHST1O43916 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHST1O43916 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHST1O43916 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHST1O43916 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHST1O43916 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHST1O43916 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHST1O43916 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHST1O43916 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHST1O43916 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHST1O43916 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHST1O43916 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHST1O43916 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHST1O43916 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHST1O43916 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHST1O43916 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHST1O43916 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHST1O43916 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHST1O43916 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHST1O43916 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHST1O43916 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHST1O43916 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHST1O43916 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHST1O43916 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHST1O43916 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHST1O43916 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHST1O43916 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHST1O43916 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHST1O43916 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHST1O43916 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHST1O43916 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHST1O43916 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHST1O43916 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHST1O43916 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CHST1O43916 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHST1O43916 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHST1O43916 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHST1O43916 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHST1O43916 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHST1O43916 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CHST1O43916 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHST1O43916 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHST1O43916 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHST1O43916 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHST1O43916 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHST1O43916 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHST1O43916 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHST1O43916 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHST1O43916 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CHST1O43916 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHST1O43916 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHST1O43916 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHST1O43916 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHST1O43916 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHST1O43916 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHST1O43916 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHST1O43916 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHST1O43916 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHST1O43916 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHST1O43916 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHST1O43916 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms