Protein–RNA interactions for Protein: O43752

STX6, Syntaxin-6, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX6O43752 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STX6O43752 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STX6O43752 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STX6O43752 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STX6O43752 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STX6O43752 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STX6O43752 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STX6O43752 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STX6O43752 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STX6O43752 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STX6O43752 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STX6O43752 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STX6O43752 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STX6O43752 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STX6O43752 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STX6O43752 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STX6O43752 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STX6O43752 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STX6O43752 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STX6O43752 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STX6O43752 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STX6O43752 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STX6O43752 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STX6O43752 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STX6O43752 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STX6O43752 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STX6O43752 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STX6O43752 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STX6O43752 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STX6O43752 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
STX6O43752 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STX6O43752 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STX6O43752 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STX6O43752 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STX6O43752 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STX6O43752 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STX6O43752 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STX6O43752 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STX6O43752 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STX6O43752 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STX6O43752 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STX6O43752 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STX6O43752 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STX6O43752 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STX6O43752 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STX6O43752 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STX6O43752 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STX6O43752 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STX6O43752 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STX6O43752 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STX6O43752 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STX6O43752 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STX6O43752 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
STX6O43752 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
STX6O43752 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STX6O43752 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STX6O43752 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STX6O43752 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STX6O43752 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STX6O43752 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STX6O43752 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STX6O43752 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STX6O43752 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STX6O43752 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STX6O43752 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STX6O43752 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STX6O43752 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STX6O43752 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
STX6O43752 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STX6O43752 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STX6O43752 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STX6O43752 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STX6O43752 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STX6O43752 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STX6O43752 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STX6O43752 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STX6O43752 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STX6O43752 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STX6O43752 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STX6O43752 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
STX6O43752 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STX6O43752 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STX6O43752 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STX6O43752 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STX6O43752 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STX6O43752 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STX6O43752 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STX6O43752 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STX6O43752 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STX6O43752 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STX6O43752 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STX6O43752 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STX6O43752 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STX6O43752 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STX6O43752 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STX6O43752 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STX6O43752 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STX6O43752 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STX6O43752 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STX6O43752 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms