Protein–RNA interactions for Protein: O43739

CYTH3, Cytohesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH3O43739 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms