Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LRRTM2O43300 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms