Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYNMO15061 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYNMO15061 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYNMO15061 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYNMO15061 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYNMO15061 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYNMO15061 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYNMO15061 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYNMO15061 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYNMO15061 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SYNMO15061 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYNMO15061 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SYNMO15061 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYNMO15061 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SYNMO15061 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYNMO15061 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYNMO15061 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
SYNMO15061 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SYNMO15061 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SYNMO15061 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SYNMO15061 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SYNMO15061 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SYNMO15061 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SYNMO15061 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SYNMO15061 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SYNMO15061 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SYNMO15061 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SYNMO15061 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SYNMO15061 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SYNMO15061 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SYNMO15061 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SYNMO15061 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SYNMO15061 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SYNMO15061 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SYNMO15061 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SYNMO15061 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SYNMO15061 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SYNMO15061 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SYNMO15061 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SYNMO15061 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SYNMO15061 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SYNMO15061 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SYNMO15061 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SYNMO15061 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SYNMO15061 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SYNMO15061 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SYNMO15061 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SYNMO15061 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SYNMO15061 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SYNMO15061 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SYNMO15061 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SYNMO15061 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SYNMO15061 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SYNMO15061 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SYNMO15061 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SYNMO15061 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SYNMO15061 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SYNMO15061 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SYNMO15061 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SYNMO15061 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SYNMO15061 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
SYNMO15061 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SYNMO15061 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SYNMO15061 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SYNMO15061 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SYNMO15061 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SYNMO15061 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SYNMO15061 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
SYNMO15061 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SYNMO15061 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SYNMO15061 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SYNMO15061 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SYNMO15061 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SYNMO15061 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SYNMO15061 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SYNMO15061 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SYNMO15061 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
SYNMO15061 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SYNMO15061 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SYNMO15061 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SYNMO15061 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SYNMO15061 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SYNMO15061 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SYNMO15061 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SYNMO15061 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SYNMO15061 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SYNMO15061 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SYNMO15061 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SYNMO15061 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SYNMO15061 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SYNMO15061 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
SYNMO15061 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SYNMO15061 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SYNMO15061 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
SYNMO15061 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SYNMO15061 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SYNMO15061 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SYNMO15061 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SYNMO15061 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SYNMO15061 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms