Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PHOX2AO14813 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms