Protein–RNA interactions for Protein: O14715

RGPD8, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD8O14715 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RGPD8O14715 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RGPD8O14715 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RGPD8O14715 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RGPD8O14715 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RGPD8O14715 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RGPD8O14715 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RGPD8O14715 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RGPD8O14715 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RGPD8O14715 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RGPD8O14715 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RGPD8O14715 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RGPD8O14715 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RGPD8O14715 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RGPD8O14715 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RGPD8O14715 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RGPD8O14715 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RGPD8O14715 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RGPD8O14715 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RGPD8O14715 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RGPD8O14715 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RGPD8O14715 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RGPD8O14715 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RGPD8O14715 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RGPD8O14715 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RGPD8O14715 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RGPD8O14715 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RGPD8O14715 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RGPD8O14715 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RGPD8O14715 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RGPD8O14715 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RGPD8O14715 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RGPD8O14715 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RGPD8O14715 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RGPD8O14715 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RGPD8O14715 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RGPD8O14715 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RGPD8O14715 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RGPD8O14715 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RGPD8O14715 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RGPD8O14715 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RGPD8O14715 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RGPD8O14715 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RGPD8O14715 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RGPD8O14715 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RGPD8O14715 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RGPD8O14715 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RGPD8O14715 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RGPD8O14715 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RGPD8O14715 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RGPD8O14715 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RGPD8O14715 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RGPD8O14715 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RGPD8O14715 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RGPD8O14715 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RGPD8O14715 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RGPD8O14715 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RGPD8O14715 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RGPD8O14715 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RGPD8O14715 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RGPD8O14715 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RGPD8O14715 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RGPD8O14715 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RGPD8O14715 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RGPD8O14715 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RGPD8O14715 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
RGPD8O14715 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
RGPD8O14715 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
RGPD8O14715 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RGPD8O14715 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RGPD8O14715 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RGPD8O14715 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RGPD8O14715 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RGPD8O14715 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RGPD8O14715 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RGPD8O14715 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RGPD8O14715 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RGPD8O14715 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RGPD8O14715 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RGPD8O14715 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RGPD8O14715 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RGPD8O14715 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RGPD8O14715 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RGPD8O14715 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RGPD8O14715 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RGPD8O14715 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RGPD8O14715 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RGPD8O14715 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RGPD8O14715 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RGPD8O14715 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RGPD8O14715 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RGPD8O14715 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RGPD8O14715 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RGPD8O14715 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RGPD8O14715 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RGPD8O14715 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RGPD8O14715 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RGPD8O14715 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RGPD8O14715 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RGPD8O14715 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms