Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTPRTO14522 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPRTO14522 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
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