Protein–RNA interactions for Protein: O00463

TRAF5, TNF receptor-associated factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF5O00463 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAF5O00463 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms