Protein–RNA interactions for Protein: H7BZ55

CROCC2, Putative ciliary rootlet coiled-coil protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROCC2H7BZ55 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CROCC2H7BZ55 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CROCC2H7BZ55 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CROCC2H7BZ55 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CROCC2H7BZ55 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CROCC2H7BZ55 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CROCC2H7BZ55 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CROCC2H7BZ55 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CROCC2H7BZ55 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CROCC2H7BZ55 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CROCC2H7BZ55 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CROCC2H7BZ55 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CROCC2H7BZ55 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CROCC2H7BZ55 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CROCC2H7BZ55 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CROCC2H7BZ55 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CROCC2H7BZ55 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CROCC2H7BZ55 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CROCC2H7BZ55 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CROCC2H7BZ55 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CROCC2H7BZ55 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CROCC2H7BZ55 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CROCC2H7BZ55 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CROCC2H7BZ55 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CROCC2H7BZ55 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CROCC2H7BZ55 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CROCC2H7BZ55 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CROCC2H7BZ55 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
CROCC2H7BZ55 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CROCC2H7BZ55 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CROCC2H7BZ55 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
CROCC2H7BZ55 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
CROCC2H7BZ55 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CROCC2H7BZ55 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CROCC2H7BZ55 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CROCC2H7BZ55 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CROCC2H7BZ55 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CROCC2H7BZ55 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CROCC2H7BZ55 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CROCC2H7BZ55 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CROCC2H7BZ55 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CROCC2H7BZ55 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CROCC2H7BZ55 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CROCC2H7BZ55 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CROCC2H7BZ55 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CROCC2H7BZ55 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CROCC2H7BZ55 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CROCC2H7BZ55 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CROCC2H7BZ55 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CROCC2H7BZ55 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CROCC2H7BZ55 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CROCC2H7BZ55 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CROCC2H7BZ55 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CROCC2H7BZ55 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CROCC2H7BZ55 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CROCC2H7BZ55 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CROCC2H7BZ55 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CROCC2H7BZ55 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CROCC2H7BZ55 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CROCC2H7BZ55 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CROCC2H7BZ55 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CROCC2H7BZ55 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CROCC2H7BZ55 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CROCC2H7BZ55 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CROCC2H7BZ55 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CROCC2H7BZ55 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CROCC2H7BZ55 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CROCC2H7BZ55 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CROCC2H7BZ55 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CROCC2H7BZ55 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CROCC2H7BZ55 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CROCC2H7BZ55 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CROCC2H7BZ55 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CROCC2H7BZ55 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CROCC2H7BZ55 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CROCC2H7BZ55 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CROCC2H7BZ55 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CROCC2H7BZ55 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CROCC2H7BZ55 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CROCC2H7BZ55 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CROCC2H7BZ55 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CROCC2H7BZ55 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CROCC2H7BZ55 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CROCC2H7BZ55 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CROCC2H7BZ55 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CROCC2H7BZ55 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CROCC2H7BZ55 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CROCC2H7BZ55 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CROCC2H7BZ55 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CROCC2H7BZ55 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CROCC2H7BZ55 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CROCC2H7BZ55 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CROCC2H7BZ55 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CROCC2H7BZ55 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CROCC2H7BZ55 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CROCC2H7BZ55 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CROCC2H7BZ55 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CROCC2H7BZ55 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CROCC2H7BZ55 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CROCC2H7BZ55 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms