Protein–RNA interactions for Protein: H3BS89

TMEM178B, Transmembrane protein 178B, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM178BH3BS89 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM178BH3BS89 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms