Protein–RNA interactions for Protein: D6R901

USP17L21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 21, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L21D6R901 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L21D6R901 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L21D6R901 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L21D6R901 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L21D6R901 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L21D6R901 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L21D6R901 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L21D6R901 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L21D6R901 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L21D6R901 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L21D6R901 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L21D6R901 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L21D6R901 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L21D6R901 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L21D6R901 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP17L21D6R901 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP17L21D6R901 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP17L21D6R901 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP17L21D6R901 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP17L21D6R901 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
USP17L21D6R901 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP17L21D6R901 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP17L21D6R901 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP17L21D6R901 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP17L21D6R901 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP17L21D6R901 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP17L21D6R901 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L21D6R901 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L21D6R901 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L21D6R901 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L21D6R901 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L21D6R901 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L21D6R901 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L21D6R901 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L21D6R901 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L21D6R901 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L21D6R901 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L21D6R901 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L21D6R901 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L21D6R901 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L21D6R901 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L21D6R901 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L21D6R901 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L21D6R901 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L21D6R901 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L21D6R901 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP17L21D6R901 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L21D6R901 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L21D6R901 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L21D6R901 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L21D6R901 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L21D6R901 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L21D6R901 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L21D6R901 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L21D6R901 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L21D6R901 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L21D6R901 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L21D6R901 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L21D6R901 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L21D6R901 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L21D6R901 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L21D6R901 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L21D6R901 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L21D6R901 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L21D6R901 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L21D6R901 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L21D6R901 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L21D6R901 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L21D6R901 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L21D6R901 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L21D6R901 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L21D6R901 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L21D6R901 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP17L21D6R901 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP17L21D6R901 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP17L21D6R901 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP17L21D6R901 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP17L21D6R901 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP17L21D6R901 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP17L21D6R901 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP17L21D6R901 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP17L21D6R901 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP17L21D6R901 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP17L21D6R901 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP17L21D6R901 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP17L21D6R901 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP17L21D6R901 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP17L21D6R901 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP17L21D6R901 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP17L21D6R901 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP17L21D6R901 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP17L21D6R901 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP17L21D6R901 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP17L21D6R901 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP17L21D6R901 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP17L21D6R901 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP17L21D6R901 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP17L21D6R901 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP17L21D6R901 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP17L21D6R901 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms