Protein–RNA interactions for Protein: B4DSR2

cDNA FLJ52234, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DSR2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DSR2 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DSR2 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DSR2 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DSR2 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DSR2 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DSR2 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DSR2 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DSR2 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DSR2 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DSR2 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DSR2 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DSR2 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DSR2 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DSR2 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DSR2 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DSR2 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DSR2 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DSR2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DSR2 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DSR2 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DSR2 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DSR2 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DSR2 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DSR2 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DSR2 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DSR2 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DSR2 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DSR2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DSR2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DSR2 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DSR2 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DSR2 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DSR2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DSR2 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DSR2 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
B4DSR2 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DSR2 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DSR2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DSR2 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DSR2 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DSR2 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DSR2 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DSR2 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DSR2 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DSR2 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DSR2 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DSR2 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DSR2 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DSR2 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DSR2 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DSR2 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DSR2 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DSR2 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DSR2 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DSR2 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DSR2 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DSR2 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DSR2 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DSR2 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DSR2 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DSR2 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DSR2 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DSR2 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DSR2 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DSR2 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DSR2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DSR2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DSR2 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DSR2 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DSR2 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DSR2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DSR2 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DSR2 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DSR2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DSR2 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DSR2 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DSR2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
B4DSR2 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DSR2 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DSR2 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DSR2 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DSR2 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DSR2 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DSR2 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DSR2 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DSR2 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DSR2 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DSR2 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DSR2 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DSR2 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DSR2 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DSR2 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DSR2 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DSR2 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DSR2 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DSR2 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DSR2 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DSR2 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
B4DSR2 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms