Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NOTOA8MTQ0 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NOTOA8MTQ0 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms