Protein–RNA interactions for Protein: A6NL46

Putative UPF0607 protein ENSP00000332738, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NL46 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
A6NL46 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
A6NL46 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
A6NL46 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
A6NL46 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
A6NL46 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
A6NL46 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
A6NL46 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
A6NL46 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
A6NL46 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
A6NL46 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
A6NL46 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
A6NL46 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
A6NL46 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
A6NL46 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
A6NL46 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
A6NL46 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
A6NL46 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
A6NL46 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
A6NL46 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
A6NL46 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
A6NL46 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
A6NL46 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
A6NL46 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
A6NL46 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
A6NL46 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
A6NL46 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
A6NL46 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
A6NL46 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
A6NL46 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
A6NL46 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
A6NL46 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
A6NL46 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
A6NL46 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
A6NL46 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
A6NL46 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
A6NL46 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
A6NL46 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
A6NL46 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
A6NL46 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
A6NL46 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
A6NL46 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
A6NL46 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
A6NL46 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
A6NL46 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
A6NL46 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
A6NL46 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
A6NL46 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
A6NL46 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
A6NL46 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
A6NL46 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
A6NL46 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
A6NL46 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
A6NL46 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
A6NL46 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
A6NL46 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
A6NL46 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
A6NL46 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
A6NL46 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
A6NL46 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
A6NL46 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
A6NL46 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
A6NL46 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
A6NL46 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
A6NL46 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
A6NL46 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
A6NL46 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
A6NL46 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
A6NL46 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
A6NL46 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
A6NL46 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
A6NL46 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
A6NL46 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
A6NL46 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
A6NL46 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
A6NL46 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
A6NL46 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
A6NL46 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
A6NL46 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
A6NL46 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
A6NL46 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
A6NL46 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
A6NL46 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
A6NL46 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
A6NL46 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
A6NL46 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
A6NL46 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
A6NL46 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
A6NL46 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
A6NL46 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
A6NL46 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
A6NL46 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
A6NL46 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
A6NL46 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
A6NL46 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
A6NL46 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
A6NL46 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
A6NL46 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
A6NL46 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
A6NL46 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms